对于统计遗传学（全基因组关联分析）的初学者来说，最难得莫过于入门，

好在GWAS问世以来已经过了十多年，该研究领域也形成了一定规模，基础内容逐渐充实，2020年出版的 An Introduction to Statistical Genetic Data Analysis 网罗该领域内研究背景，基础知识，常用工具介绍，代码实操等。

本书第一部分主要介绍相关基础内容，涵盖群体遗传学的基本概念，统计学基础，人类进化（Human evolution），GWAS，风险评分（PRS）等等基础内容。

第二部分介绍遗传数据的处理与使用，质控（QC），人群分层，PCA，等等GWAS的操作步骤。

第三部分则是介绍GWAS下游的分析方法，包括基因环境相互作用，PRS，数据可视化，MTAG，孟德尔随机化等。

原书链接： https://mitpress.mit.edu/books/introduction-statistical-genetic-data-analysis

这本书难度适中，适合初学者入门，对于理解基础概念会有很大帮助，但深度不够，个人建议可以快速阅读这本书，掌握群体遗传学研究的大致框架后，针对感兴趣的领域查找文献原文来了解细节。也可以阅读Nature Reviews Genetics上关于GWAS的综述文章，对本领域入门很有帮助。

对于希望尝试更硬核内容的同学们，我还强烈推荐这本书，Handbook of statistical genomics，本书更偏向数理原理，有大量的公式推导等，非常刺激，对于无数理基础的初学者则不太推荐此书。

除了书籍以外，其他适合入门的资料还包括：

密西根大学的开设的biostats 666这门课的slides（听着这课的名字是不是就很6）（请记住这个这位大佬的网站Genome Analysis Wiki 以后你会用到无数次的），

Biostatistics 666: Main Page

该课程也涵盖了统计遗传学中重要的概念知识点，包括了基础概念以及部分统计原理，适合快速浏览：

华盛顿大学遗传统计学夏季学校 SISG 讲义：

除了理论基础，还有代码实操等。可以跟着代码一起练习，非常适合初学者。

GWAS and Sequencing Data

另外就是大阪大学遗传统计学夏季学校的讲义分享, 我最喜欢的零基础入门其实是这个，图文并茂， 概念细节比较到位（但是是日语的，有机会了给大家翻译）：

https://www.slideshare.net/YukinoriOkada/presentations

最后，当然，还有GWASLab的主页：GWASLab

博客连接：GWAS文章索引 – Article index

以及GWAS相关文章汇总：GWASLab：全基因组关联分析GWAS文章汇总（持续更新）

我会持续更新统计遗传学，生物信息学等相关中文内容，感谢大家的关注！